More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0954 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 346 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  80.42 
 
 		 341 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  80.97 
 
 		 331 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  57.49 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  26.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.17 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.35 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.04 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.1 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.63 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.09 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  31.7 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  24.55 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  33.03 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.36 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>