15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0926 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  100 
 
 
390 aa  810    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  79.58 
 
 
378 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  68.99 
 
 
366 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  61.08 
 
 
377 aa  478  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  57.99 
 
 
392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  57.99 
 
 
392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  59.13 
 
 
366 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  57.51 
 
 
401 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  53.81 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  33.42 
 
 
401 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  30.45 
 
 
410 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  33.87 
 
 
383 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  33.33 
 
 
292 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  48.05 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  30.51 
 
 
757 aa  46.2  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>