68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0675 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
99 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  85.57 
 
 
100 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  80.81 
 
 
99 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  76.77 
 
 
99 aa  151  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  77 
 
 
100 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  74.75 
 
 
96 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  72.73 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  67.68 
 
 
98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  68.75 
 
 
96 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  64.65 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  65.66 
 
 
96 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  72.62 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  60.42 
 
 
96 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  58.82 
 
 
102 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  62.63 
 
 
96 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  56.7 
 
 
96 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  48.98 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  48.81 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  45.71 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  52.43 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  51.46 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  47.62 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  48.08 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  51.4 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  52.11 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  45.92 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  44.33 
 
 
540 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
466 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  42.27 
 
 
469 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  44.34 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  44.33 
 
 
179 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  42.86 
 
 
481 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  44.79 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  38.89 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.67 
 
 
855 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  43.06 
 
 
1379 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  43.3 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  36.84 
 
 
379 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  39.64 
 
 
592 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  43.56 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  43.56 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  36.84 
 
 
386 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  45.07 
 
 
113 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  38.14 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.05 
 
 
1422 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  42.71 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  33.33 
 
 
1556 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  38.74 
 
 
461 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 
1229 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  31.96 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  36.9 
 
 
1446 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  47.62 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  41.24 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40.57 
 
 
456 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  39.08 
 
 
1437 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  35.9 
 
 
1475 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  42.45 
 
 
456 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  35.9 
 
 
1457 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  37.11 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  42.03 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  31.96 
 
 
85 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  31.96 
 
 
88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  39.47 
 
 
1386 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.53 
 
 
1423 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 
406 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  32.99 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>