198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0566 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  71.8 
 
 
801 aa  1238    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  64.78 
 
 
780 aa  1110    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
807 aa  1677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  63.67 
 
 
786 aa  1067    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  64.31 
 
 
750 aa  1062    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  62.55 
 
 
784 aa  1041    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  62.41 
 
 
773 aa  1026    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 
799 aa  1369    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  64.31 
 
 
750 aa  1062    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  43.28 
 
 
781 aa  663    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  62.92 
 
 
785 aa  1056    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  63.55 
 
 
786 aa  1066    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  63.42 
 
 
786 aa  1063    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  63.8 
 
 
786 aa  1069    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  67.67 
 
 
787 aa  1140    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  63.05 
 
 
784 aa  1054    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  63.66 
 
 
781 aa  1065    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  72.47 
 
 
799 aa  1249    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  62.8 
 
 
784 aa  1047    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  38.71 
 
 
781 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  37.41 
 
 
781 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  36.39 
 
 
787 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  34.04 
 
 
764 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  35.24 
 
 
784 aa  462  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  33.83 
 
 
773 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  35.04 
 
 
765 aa  459  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  34.49 
 
 
766 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  34.09 
 
 
773 aa  452  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  33.84 
 
 
774 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  34.83 
 
 
774 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  33.59 
 
 
765 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  33.8 
 
 
765 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  34.17 
 
 
765 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  34.17 
 
 
765 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  33.89 
 
 
766 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  33.67 
 
 
765 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  33.59 
 
 
765 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  33.21 
 
 
765 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  33.21 
 
 
765 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  33.2 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  29.99 
 
 
750 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  31.28 
 
 
771 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  31.47 
 
 
735 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.36 
 
 
924 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  29.43 
 
 
738 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.59 
 
 
922 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  29.32 
 
 
753 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 
926 aa  300  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  27.94 
 
 
919 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.24 
 
 
905 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.18 
 
 
938 aa  293  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 
778 aa  293  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.94 
 
 
839 aa  291  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.94 
 
 
839 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.14 
 
 
932 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.86 
 
 
937 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.5 
 
 
934 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.08 
 
 
935 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.63 
 
 
728 aa  277  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
826 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  26.66 
 
 
870 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 
870 aa  260  7e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  26.34 
 
 
860 aa  258  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  28.66 
 
 
803 aa  256  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  25.85 
 
 
810 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  27 
 
 
813 aa  255  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  28.04 
 
 
788 aa  251  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 
792 aa  250  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  28.45 
 
 
788 aa  250  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  28.55 
 
 
849 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  26.6 
 
 
811 aa  248  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.11 
 
 
786 aa  247  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  26.95 
 
 
792 aa  247  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  26.54 
 
 
836 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 
813 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 
751 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 
786 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  26.22 
 
 
813 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 
789 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.1 
 
 
786 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 
786 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 
786 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 
786 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  25.81 
 
 
824 aa  237  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  26.98 
 
 
929 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
787 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  26.55 
 
 
791 aa  233  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 
761 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.92 
 
 
787 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.39 
 
 
757 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>