45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0434 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  696    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  86.14 
 
 
339 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  50.91 
 
 
338 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  44.68 
 
 
342 aa  301  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  39.33 
 
 
326 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  38.24 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  36.36 
 
 
348 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  33.43 
 
 
338 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  33.43 
 
 
338 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  38.46 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  38.07 
 
 
328 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  37.43 
 
 
348 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  33.24 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  36.66 
 
 
331 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  32.83 
 
 
359 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  33.86 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  31.79 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  34.64 
 
 
344 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  32.53 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  33.43 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  33.96 
 
 
332 aa  163  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  32.57 
 
 
327 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  32.4 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  29.78 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  25.55 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  32.41 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  33.61 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  29.41 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  40 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  27.5 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  39.39 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  43.94 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  38.24 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  25.93 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  26.26 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  31.85 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  43.06 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  42.42 
 
 
187 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  47.62 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  30.4 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>