66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0400 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  76.36 
 
 
508 aa  766    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  76.16 
 
 
508 aa  762    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  100 
 
 
505 aa  993    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  76.16 
 
 
508 aa  762    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  90.34 
 
 
507 aa  908    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  76.57 
 
 
510 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  76.77 
 
 
510 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  76.57 
 
 
508 aa  767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  77.29 
 
 
508 aa  794    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  76.57 
 
 
508 aa  767    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  76.16 
 
 
508 aa  762    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  73.47 
 
 
305 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  41.1 
 
 
512 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  40.08 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  37.7 
 
 
516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  36.42 
 
 
518 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  39.68 
 
 
538 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  38.79 
 
 
537 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  39.26 
 
 
538 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  40.76 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  79.9 
 
 
263 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  40.76 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  40.76 
 
 
535 aa  336  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  38.31 
 
 
520 aa  335  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  38.68 
 
 
539 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  36.36 
 
 
511 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  38.71 
 
 
518 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  38.01 
 
 
539 aa  332  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  38.61 
 
 
535 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.04 
 
 
512 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.04 
 
 
512 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  40.08 
 
 
540 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  39.68 
 
 
540 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  39.68 
 
 
540 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  36.06 
 
 
519 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  36.06 
 
 
519 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  36.45 
 
 
515 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  35.86 
 
 
519 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  36.71 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  36.76 
 
 
519 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  38.68 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  35.64 
 
 
519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  39.88 
 
 
511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  36.84 
 
 
534 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  36.31 
 
 
519 aa  313  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  38.34 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  38.88 
 
 
534 aa  306  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  37.88 
 
 
528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  39.08 
 
 
522 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  36.87 
 
 
532 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  33.47 
 
 
514 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  34.48 
 
 
585 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  34.83 
 
 
523 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  32.53 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  33.72 
 
 
529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  34.97 
 
 
519 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  34.57 
 
 
519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  34.77 
 
 
519 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  33.6 
 
 
519 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  33.81 
 
 
519 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  33 
 
 
518 aa  259  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  32.81 
 
 
518 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  30.58 
 
 
509 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  32.05 
 
 
552 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  70.37 
 
 
88 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0456304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>