More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0396 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.87 
 
 		 298 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  69.46 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.9 
 
 		 302 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  56.57 
 
 		 302 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  56.57 
 
 		 302 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.57 
 
 		 302 aa  358  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.57 
 
 		 302 aa  358  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.57 
 
 		 302 aa  358  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.57 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  56.23 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  56.23 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4505  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3565  DNA-binding transcriptional activator TdcA  26.03 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02985  DNA-binding transcriptional activator  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0585  transcriptional regulator, LysR family  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4431  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0908114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3306  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3414  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0580  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3592  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02936  hypothetical protein  25.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3436  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.716587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3507  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3433  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3540  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0279339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.09 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3603  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.43 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.835154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 417 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>