29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0362 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0362  protein of unknown function DUF1488  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.213184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3783  hypothetical protein  57.65 
 
 
85 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3962  protein of unknown function DUF1488  57.65 
 
 
85 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0051868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0445  protein of unknown function DUF1488  50.6 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000417841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  51.25 
 
 
85 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  50 
 
 
85 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000934197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000231665  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  48.75 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000115268  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  85.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0433  protein of unknown function DUF1488  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0433  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000050563  normal  0.0164752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03131  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000147061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3664  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3762  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3474  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000630828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03082  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3712  hypothetical protein  46.25 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000180356  normal  0.0550435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  35.56 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  39.53 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4602  hypothetical protein  44.23 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000953606  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  30.12 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  34.52 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  31.4 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>