More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0279 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 401 aa  826    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0359  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.524425  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.88 
 
 		 497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3152  sigma-54 factor, interaction region  26.1 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  34.4 
 
 		 538 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  27.17 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  30.84 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00961  hypothetical protein  24.78 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  26.85 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 1201 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  32.43 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  26.63 
 
 		 507 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  31.87 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  31.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  28.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  31.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  31.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  35.11 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  31.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  31.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.3 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  30 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  29.17 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  28.57 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0196  sigma-54 dependent transcriptional regulator  25 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 532 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  27.72 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>