More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0187 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  88.33 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  88.33 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  62.41 
 
 
728 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  45.11 
 
 
790 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  58.95 
 
 
726 aa  856    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  52.85 
 
 
709 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  62.46 
 
 
729 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  64.23 
 
 
724 aa  985    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  59.08 
 
 
720 aa  859    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  71.15 
 
 
722 aa  1070    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  60.77 
 
 
727 aa  912    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  45.66 
 
 
788 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  70.36 
 
 
722 aa  1063    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  69.49 
 
 
721 aa  1050    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  58.91 
 
 
721 aa  869    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  58.91 
 
 
721 aa  869    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  60.64 
 
 
727 aa  895    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50.07 
 
 
713 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  57.18 
 
 
723 aa  818    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  65.51 
 
 
723 aa  988    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  57.44 
 
 
725 aa  811    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.45 
 
 
726 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  87.64 
 
 
720 aa  1304    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.19 
 
 
788 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  58.33 
 
 
717 aa  852    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  62.97 
 
 
727 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  69.34 
 
 
721 aa  1045    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  45.13 
 
 
783 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.65 
 
 
787 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  70.36 
 
 
722 aa  1062    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  60.19 
 
 
730 aa  845    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  57.22 
 
 
741 aa  862    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  48.48 
 
 
743 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  69.35 
 
 
721 aa  1046    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  45.07 
 
 
787 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  86.39 
 
 
723 aa  1321    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  57.05 
 
 
723 aa  816    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  71.09 
 
 
724 aa  1077    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  64.38 
 
 
728 aa  944    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  68.53 
 
 
734 aa  1051    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  58.24 
 
 
724 aa  869    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.66 
 
 
731 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  88.33 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.26 
 
 
783 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  69.39 
 
 
722 aa  1058    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  88.33 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  58.63 
 
 
739 aa  848    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  70.36 
 
 
722 aa  1062    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.53 
 
 
787 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  62.71 
 
 
646 aa  846    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.6 
 
 
818 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  58.34 
 
 
737 aa  897    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  44.94 
 
 
846 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1338    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  70.64 
 
 
722 aa  1070    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  66.07 
 
 
724 aa  1012    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  44.69 
 
 
787 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  69.56 
 
 
726 aa  1061    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  87.78 
 
 
720 aa  1306    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  44.53 
 
 
787 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  64.33 
 
 
726 aa  984    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  58.9 
 
 
726 aa  895    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  71.15 
 
 
722 aa  1070    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  70.87 
 
 
722 aa  1066    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.33 
 
 
725 aa  870    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  69.56 
 
 
727 aa  1060    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  49.27 
 
 
744 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  70.36 
 
 
722 aa  1062    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  44.69 
 
 
840 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  64.38 
 
 
728 aa  945    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  45.91 
 
 
787 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  62.55 
 
 
728 aa  917    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  59.24 
 
 
728 aa  841    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  88.19 
 
 
720 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  62.45 
 
 
727 aa  898    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  87.36 
 
 
720 aa  1328    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  44.94 
 
 
787 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  69.57 
 
 
723 aa  1051    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  71.01 
 
 
722 aa  1068    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  87.64 
 
 
720 aa  1305    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  44.75 
 
 
786 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  44.94 
 
 
787 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  59.22 
 
 
723 aa  860    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  62.55 
 
 
728 aa  917    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  70.32 
 
 
721 aa  1050    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  52.85 
 
 
709 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  60.17 
 
 
723 aa  881    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  45.03 
 
 
787 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>