18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0169 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  100 
 
 
112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  76.36 
 
 
112 aa  180  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  70 
 
 
111 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  53.4 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  49.53 
 
 
118 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  50.47 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  49.53 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  49.53 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  50.49 
 
 
133 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  52.53 
 
 
127 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  47.62 
 
 
154 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  50.48 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  35.92 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  33.96 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  29.7 
 
 
585 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  33.98 
 
 
568 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  33.03 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  33.96 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>