More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0103 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  93.28 
 
 
255 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  92.89 
 
 
255 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  94.31 
 
 
255 aa  477  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  89.43 
 
 
255 aa  451  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  89.43 
 
 
255 aa  451  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  89.43 
 
 
255 aa  451  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  87.35 
 
 
255 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  83.4 
 
 
255 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  83.4 
 
 
255 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  83.4 
 
 
255 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  83.4 
 
 
255 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  83.4 
 
 
255 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  84.96 
 
 
255 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  83 
 
 
255 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  76.33 
 
 
255 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  71.26 
 
 
256 aa  379  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0283  triosephosphate isomerase  66.11 
 
 
256 aa  328  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001760  triosephosphate isomerase  65.69 
 
 
256 aa  326  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00709  triosephosphate isomerase  64.29 
 
 
250 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2243  triosephosphate isomerase  66.11 
 
 
265 aa  317  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  57.54 
 
 
253 aa  294  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 
253 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.44559e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 
251 aa  274  1e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
250 aa  271  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 
251 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  265  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  54 
 
 
251 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 
249 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  53.2 
 
 
251 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  50 
 
 
249 aa  258  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
251 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
251 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50 
 
 
256 aa  258  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  8.20066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
249 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51 
 
 
253 aa  255  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 
251 aa  254  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 
251 aa  254  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  52.1 
 
 
251 aa  252  5e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  52.1 
 
 
251 aa  252  5e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.78614e-07  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.72651e-05  hitchhiker  5.21404e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 
250 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.71764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.76569e-08  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21721e-05  unclonable  5.28037e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.4878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 
255 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
246 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 
248 aa  247  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
248 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  50 
 
 
249 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 
245 aa  245  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.17 
 
 
260 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.92621e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 
248 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
245 aa  245  5e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  245  5e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  50 
 
 
249 aa  245  5e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 
248 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  244  1e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  4.96067e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 
260 aa  244  1e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.2953e-06  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  244  1e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.37173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.64415e-05  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
249 aa  242  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
249 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
249 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
250 aa  239  3e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
272 aa  238  6e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  8.34169e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
256 aa  238  7e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 
250 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
250 aa  234  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 
258 aa  234  1e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
255 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
271 aa  232  4e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
250 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
259 aa  231  7e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.00734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 
252 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  45.78 
 
 
250 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  50.19 
 
 
270 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
246 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.08196e-06  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 
255 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>