More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0081 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  59.41 
 
 
813 aa  1007    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
810 aa  1654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
809 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  34.1 
 
 
810 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  28.98 
 
 
807 aa  359  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.42 
 
 
845 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  27.32 
 
 
804 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  30.22 
 
 
796 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.54 
 
 
809 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  26.22 
 
 
802 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.45 
 
 
813 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.52 
 
 
817 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  27.38 
 
 
797 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  26.25 
 
 
805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.2 
 
 
808 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  27.74 
 
 
804 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  26.97 
 
 
843 aa  277  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  26.46 
 
 
810 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  28.19 
 
 
808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.84 
 
 
807 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  26.99 
 
 
821 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.35 
 
 
805 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  27.04 
 
 
809 aa  267  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.48 
 
 
805 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  27.7 
 
 
798 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 
816 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.63 
 
 
871 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  26.16 
 
 
803 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.07 
 
 
807 aa  257  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.32 
 
 
822 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.55 
 
 
878 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.51 
 
 
869 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  28.28 
 
 
811 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.73 
 
 
814 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.03 
 
 
805 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  27.11 
 
 
805 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  26.13 
 
 
803 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.09 
 
 
823 aa  247  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.91 
 
 
882 aa  245  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  26.8 
 
 
806 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.21 
 
 
844 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  28.47 
 
 
819 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  27.88 
 
 
808 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  26.43 
 
 
817 aa  238  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.24 
 
 
849 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.66 
 
 
809 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.49 
 
 
893 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  25.79 
 
 
810 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  26.99 
 
 
808 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.68 
 
 
874 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.1 
 
 
805 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.15 
 
 
817 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  26.87 
 
 
848 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  24.14 
 
 
865 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  26.12 
 
 
816 aa  214  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  26.09 
 
 
800 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.02 
 
 
915 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  26.3 
 
 
887 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.31 
 
 
919 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  26.79 
 
 
808 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  24.71 
 
 
831 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.39 
 
 
884 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.97 
 
 
821 aa  203  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  26.51 
 
 
835 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.68 
 
 
883 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.07 
 
 
913 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  26.17 
 
 
803 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.15 
 
 
810 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  26.09 
 
 
887 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.83 
 
 
862 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.23 
 
 
844 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.12 
 
 
879 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.19 
 
 
880 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23 
 
 
828 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.32 
 
 
855 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  25.81 
 
 
819 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.9 
 
 
888 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.14 
 
 
812 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  25.78 
 
 
861 aa  167  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.63 
 
 
846 aa  157  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.78 
 
 
820 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
804 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 
806 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
805 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 
791 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
793 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
811 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 
805 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
777 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 
795 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
784 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 
810 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 
803 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
805 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 
790 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 
804 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
794 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 
794 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
808 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 
792 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>