More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0079 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  85.03 
 
 		 185 aa  333  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 295 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  37.17 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  32.19 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 369 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  25.4 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 351 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09770  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 340 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0907  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 278 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  32.63 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  32.69 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  32.69 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 436 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  32.69 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.45 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  32.69 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  32.69 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30.3 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.85 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  26.4 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.96 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 276 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 293 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 327 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>