154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0046 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 
211 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  71.09 
 
 
212 aa  326  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  72.04 
 
 
212 aa  316  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.15 
 
 
215 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  68.1 
 
 
213 aa  298  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  67.14 
 
 
218 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  66.67 
 
 
218 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  66.67 
 
 
218 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  64.73 
 
 
214 aa  294  7e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  67.65 
 
 
214 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  65.73 
 
 
218 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  64.79 
 
 
218 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  63.81 
 
 
211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  64.29 
 
 
232 aa  280  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  64.42 
 
 
229 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  63.46 
 
 
216 aa  277  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  63.77 
 
 
211 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  67.69 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  65.5 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  63.81 
 
 
217 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  60.98 
 
 
217 aa  269  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  58.57 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  66.15 
 
 
205 aa  268  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  60.95 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  55.92 
 
 
211 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  55.71 
 
 
211 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  55.17 
 
 
206 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  55.17 
 
 
206 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  52.61 
 
 
216 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  54.15 
 
 
216 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  59.02 
 
 
214 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  54.25 
 
 
216 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  53.77 
 
 
216 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  54.63 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  56.52 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  53.43 
 
 
214 aa  232  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  53.47 
 
 
211 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  52.68 
 
 
212 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  70 
 
 
179 aa  228  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  54.23 
 
 
208 aa  225  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  54.77 
 
 
202 aa  222  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  55.22 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  52.82 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  52.48 
 
 
221 aa  218  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  50.99 
 
 
223 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  49.01 
 
 
214 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  49.01 
 
 
214 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  49.01 
 
 
214 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  49.2 
 
 
238 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.63 
 
 
224 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  35.78 
 
 
243 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  38.07 
 
 
207 aa  144  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  37.8 
 
 
244 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  37.75 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.31 
 
 
251 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  34.31 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.95 
 
 
244 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  31.55 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  33.17 
 
 
277 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  34.33 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.18 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  34.63 
 
 
280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  32.84 
 
 
269 aa  111  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  32.54 
 
 
251 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  32.54 
 
 
251 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  30.39 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  32.35 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  33.68 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.5 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  32.06 
 
 
251 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  33.68 
 
 
273 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.95 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  33.5 
 
 
270 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  31.82 
 
 
275 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  31.53 
 
 
242 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  33.82 
 
 
204 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  32.47 
 
 
248 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30.24 
 
 
245 aa  101  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.5 
 
 
235 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  30.39 
 
 
277 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  30.77 
 
 
287 aa  101  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.9 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  32.82 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  31.98 
 
 
248 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  34.04 
 
 
238 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.17 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  31.55 
 
 
283 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  29.08 
 
 
280 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  29.67 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  34.2 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  34.2 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  34.2 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.51 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  29.3 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  31.44 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.33 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  34.24 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>