29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0036 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  88.06 
 
 
402 aa  744    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  88.06 
 
 
402 aa  744    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  830    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  91.54 
 
 
402 aa  775    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  66.92 
 
 
402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  49.24 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  50.62 
 
 
404 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  49.35 
 
 
404 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  48.99 
 
 
405 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  50 
 
 
381 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  44.06 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  43.75 
 
 
391 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  42.27 
 
 
423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  35.74 
 
 
395 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  28 
 
 
354 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  26.9 
 
 
392 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  27.25 
 
 
365 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  24.86 
 
 
376 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  25.69 
 
 
339 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  25.15 
 
 
375 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  24.57 
 
 
353 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  25.64 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  29.81 
 
 
109 aa  53.5  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  25.97 
 
 
279 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  24.4 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  25.69 
 
 
276 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  23.32 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  23.55 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>