More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0035 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  77.83 
 
 		 417 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  77.59 
 
 		 417 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 418 aa  859    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  77.16 
 
 		 416 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  77.16 
 
 		 416 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  77.83 
 
 		 417 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  77.59 
 
 		 417 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  77.83 
 
 		 417 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  77.83 
 
 		 417 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  77.4 
 
 		 416 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  79.6 
 
 		 402 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  77.59 
 
 		 417 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  77.59 
 
 		 417 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  79.09 
 
 		 456 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  76.39 
 
 		 416 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  83.41 
 
 		 416 aa  748    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  77.4 
 
 		 416 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  81.93 
 
 		 440 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  83.41 
 
 		 417 aa  747    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  79.09 
 
 		 421 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  77.16 
 
 		 416 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  86.99 
 
 		 417 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  77.83 
 
 		 417 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  65.87 
 
 		 417 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  65.87 
 
 		 417 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  65.55 
 
 		 418 aa  591  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  64.82 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  63.61 
 
 		 415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  63.59 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  62.38 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  54.13 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  51.3 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  49.53 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  45.66 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  46.12 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  44.03 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  44.39 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  42.24 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  42.37 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  39.18 
 
 		 419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  39.09 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  36.82 
 
 		 427 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  36.69 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  35.44 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  23.98 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.62 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  25.37 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  26.17 
 
 		 480 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25.24 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  27.3 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  25.2 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  22.56 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  23.48 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  25.06 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  24.45 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  26.12 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  26.12 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  26.08 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  26.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  25.65 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.71 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  27.23 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  25.57 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  24.88 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  22.73 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  29.86 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  22.08 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  21.68 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  24.01 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  27.51 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  25.07 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  22.65 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  30.08 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  23.92 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  23.28 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>