More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0019 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  92.21 
 
 
156 aa  297  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 
158 aa  183  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
153 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
155 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
175 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
154 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
175 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
175 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
175 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 
147 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
229 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
202 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
169 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
154 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
202 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.75 
 
 
229 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
175 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
153 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 
153 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
175 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
175 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
155 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
153 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
154 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
175 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  45.1 
 
 
158 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
213 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  44.16 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
174 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
156 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
161 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
153 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
159 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
156 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  44.44 
 
 
159 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.11 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.48 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  42.48 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.76 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
162 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
162 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
162 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
159 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  35.53 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
152 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
163 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
154 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
165 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
152 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
152 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.47 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
169 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>