202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3459 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  70.9 
 
 
190 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  67.72 
 
 
190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  67.02 
 
 
191 aa  271  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  65.26 
 
 
191 aa  267  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  66.15 
 
 
191 aa  266  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  65.79 
 
 
191 aa  264  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  66.15 
 
 
192 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  65.61 
 
 
191 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  64.02 
 
 
190 aa  258  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  64.06 
 
 
192 aa  257  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  64.55 
 
 
191 aa  255  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  63.83 
 
 
191 aa  255  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  61.38 
 
 
190 aa  254  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  63.16 
 
 
191 aa  254  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  62.96 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  61.58 
 
 
191 aa  251  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  60.94 
 
 
192 aa  249  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  60.64 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  62.9 
 
 
191 aa  235  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  58.06 
 
 
190 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  56.91 
 
 
191 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  56.91 
 
 
190 aa  225  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  56.32 
 
 
191 aa  223  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  55.32 
 
 
188 aa  217  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  54.31 
 
 
197 aa  216  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  52.38 
 
 
179 aa  209  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  52.06 
 
 
195 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  51.03 
 
 
195 aa  204  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  50.8 
 
 
179 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  50.8 
 
 
179 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  53.97 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  50.53 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  50.53 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  51.6 
 
 
179 aa  197  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  49.74 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  52.63 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  53.44 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  49.21 
 
 
179 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  51.37 
 
 
178 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  50.53 
 
 
178 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  50 
 
 
178 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  49.74 
 
 
180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  49.22 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  48.35 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  48.7 
 
 
194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  48.44 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  49.46 
 
 
221 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  48.7 
 
 
194 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  46.88 
 
 
194 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  49.21 
 
 
177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  45.16 
 
 
392 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  45.45 
 
 
696 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  44.9 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.98 
 
 
696 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  42.56 
 
 
194 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  41.97 
 
 
195 aa  157  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  42.55 
 
 
194 aa  157  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.89 
 
 
233 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  37.77 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  37.77 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  44.07 
 
 
215 aa  140  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  43.89 
 
 
216 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  40.64 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  40.64 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  40.64 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  43.33 
 
 
215 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  40.44 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  45.86 
 
 
139 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  36.87 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.52 
 
 
140 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  44.6 
 
 
139 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  44.6 
 
 
139 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  44.6 
 
 
139 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.66 
 
 
139 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  43.7 
 
 
143 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.86 
 
 
140 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  33.71 
 
 
165 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  43.94 
 
 
146 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  43.7 
 
 
140 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  32.4 
 
 
164 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  43.36 
 
 
140 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.65 
 
 
168 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  44.78 
 
 
140 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  43.94 
 
 
139 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  34.27 
 
 
165 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  43.28 
 
 
140 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  43.28 
 
 
140 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  43.28 
 
 
140 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  43.94 
 
 
139 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  42.54 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  43.61 
 
 
140 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>