264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3357 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
338 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  47.88 
 
 
283 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  42.86 
 
 
285 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  38.21 
 
 
304 aa  225  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  44.54 
 
 
296 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  43.56 
 
 
319 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
274 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
286 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 
272 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
273 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 
274 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 
291 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.51 
 
 
359 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 
291 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 
291 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
274 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
281 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 
274 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
291 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 
357 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 
381 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 
281 aa  99.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 
336 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 
285 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33.57 
 
 
348 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.3 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 
272 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
275 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.57 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
287 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 
271 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 
283 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
369 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 
304 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 
325 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.54 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 
326 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 
362 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
333 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  38.53 
 
 
285 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  27.64 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.09 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.59 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  28.01 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.18 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>