More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3332 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 138 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  54.62 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  47.41 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  46.38 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  49.35 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  37.39 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  49.32 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  29.55 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.62 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>