More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3314 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3314  phosphocarrier, HPr family  100 
 
 
92 aa  188  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2016  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.88 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1090  HPrNtr  52.38 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2878  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.09 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2151  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1795  phosphocarrier, HPr family  56.94 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0773  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106388  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.91 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  40.7 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  40.7 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2230  HPrNtr  44.71 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.02 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.53 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.24 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  35.96 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.02 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  39.08 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0167  HPrNtr  43.75 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  41.38 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4547  phosphocarrier protein NPr  43.9 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.53 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  39.53 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.25 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.37 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.46 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  40.24 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.29 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.5 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.44 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  39.53 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.44 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  39.02 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  40.24 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2113  phosphocarrier protein NPr  41.86 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0716  phosphocarrier protein HPr  34.21 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.97 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.556277  normal  0.0145847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3108  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.36 
 
 
846 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.899146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  36.78 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  37.21 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  38.1 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.09 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0360  phosphocarrier, HPr family  36.59 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0485  phosphotransferase system, HPr  40 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.467636  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14490  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.75 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00608366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  36.47 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  36.47 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.82 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.24 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2895  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.76 
 
 
819 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00460973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0669  HPr family phosphocarrier protein  41.18 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0255747  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3965  phosphocarrier protein NPR  40 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3661  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of N-regulated PTS system (Npr)  37.21 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.51 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0572  HPr family phosphocarrier protein  36.67 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3353  HPr family phosphocarrier protein  40 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.056229  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0668  HPr family phosphocarrier protein  40 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0597918  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0090  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  36.05 
 
 
378 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.57 
 
 
88 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  39.76 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3819  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of N-regulated PTS system (Npr)  36.05 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3771  HPr family phosphocarrier protein  34.52 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  37.18 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4856  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtnE  35.96 
 
 
793 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.969438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002399  phosphocarrier protein nitrogen regulation associated  41.57 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2861  multiphosphoryl transfer protein  35.87 
 
 
844 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  37.18 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3381  phosphocarrier, HPr family protein  40 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.497363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0494  phosphocarrier protein NPr  35.96 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0712  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0372719  normal  0.29399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>