More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3280 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
341 aa  699    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 
352 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.94 
 
 
341 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
327 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
342 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  37.61 
 
 
321 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 
1250 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
274 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
347 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
280 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
308 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
361 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
347 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
373 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.54 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.44 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
339 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
663 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  32.63 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
340 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
398 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
333 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
304 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
336 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
364 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
269 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
305 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
384 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
250 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
336 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
347 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.01 
 
 
255 aa  96.3  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  31.22 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
345 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.05 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
727 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
264 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
255 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  29.02 
 
 
260 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
351 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.55 
 
 
321 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  31.45 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  33.01 
 
 
249 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
473 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  33.97 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
1177 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
276 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
1177 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  30.7 
 
 
272 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
357 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
303 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
334 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  28.37 
 
 
308 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
331 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
373 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>