More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3268 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
629 aa  1268    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.3 
 
 
642 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  52.71 
 
 
649 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.68 
 
 
635 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.97 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.75 
 
 
626 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  45.56 
 
 
614 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.37 
 
 
647 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.77 
 
 
644 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.19 
 
 
647 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.38 
 
 
614 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  43.02 
 
 
625 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  44.15 
 
 
647 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.54 
 
 
625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.35 
 
 
651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.5 
 
 
617 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.5 
 
 
638 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.69 
 
 
628 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.9 
 
 
627 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.48 
 
 
613 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  43.33 
 
 
656 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.31 
 
 
627 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  42.83 
 
 
637 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.95 
 
 
629 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.47 
 
 
630 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  42.83 
 
 
637 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  44.48 
 
 
615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 
607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.98 
 
 
627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.37 
 
 
612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.98 
 
 
627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.12 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.98 
 
 
627 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  41.53 
 
 
635 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.36 
 
 
670 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.07 
 
 
620 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.74 
 
 
633 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.11 
 
 
610 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.58 
 
 
630 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.79 
 
 
613 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.33 
 
 
637 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.22 
 
 
682 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  42.58 
 
 
603 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.55 
 
 
633 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  42.58 
 
 
604 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.03 
 
 
609 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.07 
 
 
650 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 
612 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  41.99 
 
 
642 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.23 
 
 
643 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.65 
 
 
619 aa  409  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  40.89 
 
 
684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.09 
 
 
645 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.29 
 
 
628 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.46 
 
 
623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.59 
 
 
664 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.72 
 
 
634 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.07 
 
 
680 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 
656 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.86 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  41.09 
 
 
621 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.08 
 
 
671 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.99 
 
 
647 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 
648 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  40.92 
 
 
621 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.12 
 
 
655 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.36 
 
 
643 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.79 
 
 
676 aa  399  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  40.76 
 
 
621 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 
664 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.66 
 
 
649 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.87 
 
 
652 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.12 
 
 
627 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.81 
 
 
646 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.2 
 
 
647 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.18 
 
 
628 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.62 
 
 
688 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  39.27 
 
 
665 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 
646 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.66 
 
 
664 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.09 
 
 
649 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.31 
 
 
614 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.51 
 
 
670 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.03 
 
 
675 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  40.82 
 
 
664 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.82 
 
 
643 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  41.05 
 
 
644 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  43.2 
 
 
646 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.84 
 
 
669 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.47 
 
 
653 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.98 
 
 
613 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.49 
 
 
660 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.27 
 
 
664 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.47 
 
 
665 aa  382  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  39.43 
 
 
670 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>