More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3263 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
242 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.19 
 
 
241 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  47.03 
 
 
234 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  47.73 
 
 
237 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 
247 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
315 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 
349 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
309 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
321 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  37.26 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.61 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  34.4 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
350 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.95 
 
 
313 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  32.62 
 
 
313 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
341 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
325 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
332 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.9 
 
 
313 aa  101  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.54 
 
 
331 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
338 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
324 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  30.99 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  32.16 
 
 
339 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
338 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
311 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  31.22 
 
 
332 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
390 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
312 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 
350 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
342 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
310 aa  85.1  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
310 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1250 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.32 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.19 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.76 
 
 
302 aa  75.1  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
310 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.52 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
663 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
1171 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
581 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.37 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
301 aa  72  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.3 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
347 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.64 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  26.41 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  25.35 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
727 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
597 aa  68.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  34.62 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
336 aa  68.6  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>