More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3248 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  100 
 
 		 654 aa  1337    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  52.15 
 
 		 656 aa  672    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  51.61 
 
 		 656 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  51.75 
 
 		 697 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  51.96 
 
 		 709 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  51.44 
 
 		 748 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  42.41 
 
 		 754 aa  339  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  43.43 
 
 		 822 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  34.65 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  39.59 
 
 		 792 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  40.18 
 
 		 790 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  39.65 
 
 		 792 aa  220  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  39.15 
 
 		 790 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  43.03 
 
 		 696 aa  218  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  38.89 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  39.19 
 
 		 818 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.96 
 
 		 847 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.95 
 
 		 848 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  41.61 
 
 		 886 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  34.68 
 
 		 746 aa  193  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.85 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.03 
 
 		 810 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  39.7 
 
 		 872 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  32.09 
 
 		 783 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.13 
 
 		 411 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  43.07 
 
 		 835 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  43.51 
 
 		 746 aa  180  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  35.2 
 
 		 839 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  40.08 
 
 		 805 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.24 
 
 		 723 aa  177  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  37.74 
 
 		 716 aa  177  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  33.76 
 
 		 722 aa  177  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  41 
 
 		 783 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  35.29 
 
 		 836 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  41 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  34.16 
 
 		 838 aa  174  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  39.73 
 
 		 805 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  35.49 
 
 		 442 aa  173  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  36.13 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  40 
 
 		 817 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  37.4 
 
 		 736 aa  171  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  41 
 
 		 783 aa  171  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.01 
 
 		 411 aa  170  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  35.46 
 
 		 862 aa  170  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  41.57 
 
 		 835 aa  170  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  40.55 
 
 		 835 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  32.63 
 
 		 430 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  40.81 
 
 		 825 aa  169  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.63 
 
 		 828 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.86 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  37.69 
 
 		 826 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.5 
 
 		 406 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.27 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  41.95 
 
 		 747 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  35.86 
 
 		 406 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  33.61 
 
 		 409 aa  164  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  33.61 
 
 		 409 aa  164  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.33 
 
 		 840 aa  163  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  40.46 
 
 		 757 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  41.95 
 
 		 748 aa  161  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  34.8 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  37.13 
 
 		 873 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  35.25 
 
 		 439 aa  160  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  38.34 
 
 		 839 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  34.04 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  39.13 
 
 		 837 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  36.47 
 
 		 851 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  35.24 
 
 		 823 aa  158  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  33.61 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.32 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  29.76 
 
 		 663 aa  158  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37 
 
 		 427 aa  157  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  30.77 
 
 		 419 aa  157  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  42.18 
 
 		 835 aa  156  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  34.78 
 
 		 420 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  39.56 
 
 		 826 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  33.52 
 
 		 652 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  36.24 
 
 		 852 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  30.76 
 
 		 663 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  39.77 
 
 		 878 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  38.06 
 
 		 877 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  30.25 
 
 		 396 aa  153  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  34.08 
 
 		 422 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  39.27 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  37.91 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  34.93 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  35.1 
 
 		 669 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  34.19 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  33.7 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  34.2 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  38.98 
 
 		 832 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  36.16 
 
 		 403 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  31.97 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  39.41 
 
 		 841 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.26 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  36.73 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  35.1 
 
 		 662 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  34.64 
 
 		 666 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  36.46 
 
 		 412 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.17 
 
 		 426 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>