175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3201 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 
408 aa  835    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  64.79 
 
 
407 aa  544  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  61.99 
 
 
384 aa  501  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  59.69 
 
 
384 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  60.46 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  54.45 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  39.71 
 
 
398 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  36.7 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  36.43 
 
 
393 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  36.09 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.31 
 
 
382 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.16 
 
 
385 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.84 
 
 
367 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  36.63 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.36 
 
 
193 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  38.61 
 
 
148 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  24.42 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.36 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35.23 
 
 
129 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  32.32 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  24.22 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.14 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  25.64 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.14 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.31 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.98 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.68 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  26.95 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  32.35 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  30.61 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  23.12 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.66 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  29.81 
 
 
193 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.77 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  31.31 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  36.89 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.89 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  36.89 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  32.85 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  37.97 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  30.77 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  29.67 
 
 
182 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.69 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
186 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  28.16 
 
 
184 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
174 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  28.42 
 
 
189 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  23.5 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  25 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.27 
 
 
193 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.65 
 
 
184 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  32.35 
 
 
192 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.35 
 
 
192 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  23.22 
 
 
377 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
193 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  24.12 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  22.73 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  29.89 
 
 
204 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.35 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  33.03 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.05 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.01 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  22.13 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  21.77 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.67 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  31.4 
 
 
238 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  27.47 
 
 
194 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  28.89 
 
 
213 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  28.89 
 
 
213 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.08 
 
 
160 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 
238 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  23.24 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  28.89 
 
 
185 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30.39 
 
 
502 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  31.03 
 
 
177 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  31.08 
 
 
202 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  43.94 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.56 
 
 
188 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.29 
 
 
502 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.84 
 
 
502 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  32.18 
 
 
204 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.68 
 
 
202 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  32.67 
 
 
253 aa  56.6  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  32.89 
 
 
239 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.73 
 
 
508 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  22.77 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  22.28 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25.15 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  36.49 
 
 
195 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  23 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.82 
 
 
200 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  23.38 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35 
 
 
230 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  22.36 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.03 
 
 
190 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.87 
 
 
203 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>