More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3176 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  46.8 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.63 
 
 
258 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  50.21 
 
 
267 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.59 
 
 
255 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
258 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  44.26 
 
 
252 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.26 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.28 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.23 
 
 
244 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.27 
 
 
258 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
256 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.1 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.64 
 
 
254 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.74 
 
 
254 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.8 
 
 
244 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.64 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.54 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.44 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.7 
 
 
255 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.03 
 
 
246 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.64 
 
 
249 aa  175  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.5 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.45 
 
 
254 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  40.89 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  40.49 
 
 
255 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.49 
 
 
255 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.87 
 
 
253 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.87 
 
 
253 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.83 
 
 
243 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
254 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  42.23 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000394678  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  40.32 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  38.8 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  38.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  38.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  38.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  38.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 
277 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.84 
 
 
258 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.08 
 
 
270 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 
275 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 
270 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
244 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  37.6 
 
 
266 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.51 
 
 
237 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  37.6 
 
 
268 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.05 
 
 
269 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  37.4 
 
 
272 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
254 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 
272 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.93 
 
 
242 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  36.61 
 
 
269 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.65 
 
 
255 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.27 
 
 
269 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
268 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4181  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.76 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0515522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.87 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  34.88 
 
 
275 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.87 
 
 
271 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
248 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.84 
 
 
248 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  37.2 
 
 
266 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.43 
 
 
265 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.27 
 
 
269 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.37 
 
 
252 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  41.18 
 
 
236 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  36 
 
 
240 aa  151  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.5 
 
 
275 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.48 
 
 
269 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  34.5 
 
 
275 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.6 
 
 
273 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.75 
 
 
244 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.65 
 
 
277 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  37.89 
 
 
257 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  37.89 
 
 
257 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000336589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.46 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  37.11 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  38.49 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.43 
 
 
295 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  38.49 
 
 
270 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.72 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  37.5 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>