More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3172 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 784 aa  1575    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 864 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 795 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 807 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  31.84 
 
 		 816 aa  291  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 981 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  45.21 
 
 		 843 aa  238  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  43.46 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  41.99 
 
 		 874 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  43.72 
 
 		 840 aa  188  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  39.41 
 
 		 832 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  38.08 
 
 		 299 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  42.79 
 
 		 322 aa  183  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 845 aa  180  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  41.44 
 
 		 685 aa  178  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  42.86 
 
 		 782 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 844 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 		 861 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  37.55 
 
 		 825 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1118 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 847 aa  170  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1118 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1118 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  39.15 
 
 		 847 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1120 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1120 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  39.23 
 
 		 796 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.77 
 
 		 472 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  43.3 
 
 		 752 aa  168  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1118 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  41.12 
 
 		 1110 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 560 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  39.46 
 
 		 1111 aa  167  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  38.62 
 
 		 849 aa  167  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.89 
 
 		 1115 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  42.36 
 
 		 860 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 842 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  41.38 
 
 		 1130 aa  163  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 321 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  36.16 
 
 		 1120 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  33.22 
 
 		 287 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  36.16 
 
 		 1120 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  36.16 
 
 		 1120 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 447 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 636 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 636 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  35.43 
 
 		 1133 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 		 447 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  37.12 
 
 		 1134 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  37.12 
 
 		 1134 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  32.1 
 
 		 1117 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 867 aa  157  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  39.52 
 
 		 1117 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  36.2 
 
 		 1102 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  38.27 
 
 		 1118 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  38.27 
 
 		 1118 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  41.28 
 
 		 291 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 1166 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  39.57 
 
 		 1128 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 303 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1102 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 830 aa  154  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 859 aa  154  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 456 aa  154  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  39.82 
 
 		 753 aa  152  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 1158 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  37.25 
 
 		 448 aa  152  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 1105 aa  151  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  36.33 
 
 		 825 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 868 aa  151  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 877 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  34.23 
 
 		 1098 aa  151  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 1127 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  27.15 
 
 		 813 aa  150  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 1235 aa  150  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  39.31 
 
 		 338 aa  150  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  40.93 
 
 		 298 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 444 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 		 785 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 451 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  35.17 
 
 		 891 aa  148  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  40.86 
 
 		 1110 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  35.92 
 
 		 329 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.27 
 
 		 1144 aa  144  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 444 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 637 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 294 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>