107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3155 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  49.37 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  53.16 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  47.14 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  49.21 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  42.11 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  40.54 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  43.28 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  41.03 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  42.67 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  34.33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  47.14 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  45.21 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  36.76 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  36.76 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  43.75 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  43.75 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  42.19 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  41.33 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  41.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  40.62 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  45.31 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  43.75 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  45.31 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  45.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  42.25 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  34.33 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  34.33 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  39.73 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  42.65 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  43.75 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  45.33 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  37.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  37.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  37.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  37.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  40.24 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  43.75 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  50.85 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  41.1 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.53 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  38.1 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  41.43 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.68 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  53.06 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  49.15 
 
 		 133 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  38.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  49.15 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  34.15 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  47.27 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  34.15 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  43.28 
 
 		 128 aa  42  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  41.33 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  40 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  32.93 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.87 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  53.33 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  34.21 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  35.29 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>