138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3138 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
208 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  68.63 
 
 
204 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  67.01 
 
 
204 aa  248  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  53.54 
 
 
197 aa  204  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  52.91 
 
 
204 aa  200  1e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  64.56 
 
 
207 aa  188  6e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  63.05 
 
 
204 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  50 
 
 
203 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  45.73 
 
 
208 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  53.3 
 
 
211 aa  171  7e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  48.31 
 
 
211 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50.75 
 
 
430 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.43 
 
 
198 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47.96 
 
 
198 aa  157  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.16 
 
 
201 aa  151  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  43.28 
 
 
211 aa  147  1e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  43.28 
 
 
211 aa  147  1e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  42.13 
 
 
194 aa  125  4e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  44.22 
 
 
205 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  39.29 
 
 
195 aa  113  2e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  38.19 
 
 
193 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  43.22 
 
 
205 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  35.61 
 
 
201 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  40.65 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
204 aa  76.3  4e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.16 
 
 
246 aa  73.9  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  30.87 
 
 
230 aa  73.2  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.05 
 
 
241 aa  72.4  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.39 
 
 
241 aa  72  6e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.39 
 
 
241 aa  72  6e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
197 aa  70.5  2e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.77 
 
 
328 aa  70.1  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.51 
 
 
354 aa  68.2  9e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.39 
 
 
326 aa  67  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.51 
 
 
352 aa  64.7  9e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.47 
 
 
310 aa  64.7  1e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  28.96 
 
 
226 aa  63.9  1e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  36.5 
 
 
231 aa  63.2  3e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  31.75 
 
 
343 aa  61.2  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  40.87 
 
 
226 aa  60.1  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.97 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.36 
 
 
347 aa  59.3  4e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.64 
 
 
202 aa  58.9  6e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.38 
 
 
359 aa  58.5  7e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.17 
 
 
355 aa  58.5  7e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38373e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.4 
 
 
333 aa  58.2  8e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.66 
 
 
306 aa  58.2  9e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  32.88 
 
 
352 aa  58.2  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  58.2  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.75 
 
 
236 aa  57.4  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  29.77 
 
 
230 aa  57  2e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.39 
 
 
242 aa  57  2e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.1 
 
 
202 aa  57  2e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.61 
 
 
299 aa  56.2  3e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  29.86 
 
 
247 aa  55.8  4e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  29.41 
 
 
247 aa  55.8  4e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.98 
 
 
348 aa  55.1  8e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7293e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  29.22 
 
 
599 aa  54.3  1e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.15 
 
 
216 aa  54.7  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  26.52 
 
 
339 aa  54.3  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  30.23 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.13 
 
 
213 aa  53.9  2e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.56 
 
 
307 aa  53.9  2e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  32.04 
 
 
217 aa  53.9  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.94 
 
 
331 aa  53.5  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.94 
 
 
235 aa  53.9  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.08 
 
 
421 aa  53.1  3e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.88 
 
 
229 aa  53.1  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  30.7 
 
 
225 aa  53.1  3e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.95 
 
 
348 aa  52.4  5e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  30.99 
 
 
225 aa  52  6e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.56 
 
 
342 aa  52  6e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.7 
 
 
250 aa  52  7e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.22 
 
 
238 aa  51.6  7e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  23.94 
 
 
212 aa  52  7e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.06 
 
 
249 aa  52  7e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  51.6  7e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  34.51 
 
 
239 aa  51.6  9e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.18 
 
 
238 aa  50.8  1e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  27.36 
 
 
321 aa  51.2  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  28.97 
 
 
256 aa  50.8  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.37 
 
 
218 aa  50.4  2e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.27 
 
 
231 aa  50.4  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.9 
 
 
337 aa  50.4  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.3 
 
 
232 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.62 
 
 
202 aa  50.4  2e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.3 
 
 
232 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.3 
 
 
232 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  30.28 
 
 
225 aa  50.1  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  30.28 
 
 
251 aa  49.7  3e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.96 
 
 
219 aa  49.7  3e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  49.3  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  34.78 
 
 
330 aa  48.5  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.74 
 
 
232 aa  48.1  9e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.02 
 
 
235 aa  48.1  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>