More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3129 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 415 aa  854    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  65.62 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  43.17 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  42.47 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  40.16 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  36.71 
 
 		 487 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  37.37 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  35.66 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  34.9 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  38.89 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  33.17 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  36.22 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  35.64 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  34.17 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  33.75 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  34.37 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  32.35 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  32.27 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  31.5 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  30.02 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.18 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  30.45 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  31.28 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  32.6 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  29.56 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.71 
 
 		 402 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  31.57 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  36.34 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.9 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  29.78 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  30.87 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  31.92 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  29.06 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  30.42 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  28.97 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  31.62 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  29.49 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  30.03 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  27.75 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  30.39 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  30.75 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  25.99 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.65 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.65 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 431 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  25.68 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  24.65 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  25.93 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.91 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.79 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  25.6 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.68 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  24.05 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  24.94 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  26.49 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  23.32 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.99 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.13 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.32 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  27.34 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  27.84 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  26.46 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  26.57 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.22 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  23.39 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  29.55 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.97 
 
 		 743 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000652876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  23.86 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.18 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>