More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3121 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  39.28 
 
 		 1078 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  40.95 
 
 		 1032 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  42.59 
 
 		 1174 aa  813    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  52.74 
 
 		 1089 aa  1088    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1033 aa  2108    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  50.53 
 
 		 1027 aa  961    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  40.06 
 
 		 1001 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  39.38 
 
 		 1050 aa  622  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 		 1062 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  38.13 
 
 		 1089 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  41.34 
 
 		 1132 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  42.59 
 
 		 1075 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 1161 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  41.69 
 
 		 1082 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 1067 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 1232 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  60.81 
 
 		 1244 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  57.08 
 
 		 1127 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  39.68 
 
 		 1124 aa  522  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  56.56 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  54.42 
 
 		 428 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  53.14 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  51.07 
 
 		 1156 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  48.69 
 
 		 414 aa  423  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.97 
 
 		 411 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  50.72 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  43.44 
 
 		 414 aa  356  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  32.33 
 
 		 457 aa  208  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  32.85 
 
 		 409 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 681 aa  184  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  31.93 
 
 		 372 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 393 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.41 
 
 		 689 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  27.99 
 
 		 394 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 401 aa  166  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 373 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.47 
 
 		 394 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.98 
 
 		 709 aa  163  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 394 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  27 
 
 		 424 aa  162  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  29.16 
 
 		 380 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 682 aa  156  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 659 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.14 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.42 
 
 		 713 aa  151  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  29.93 
 
 		 682 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 717 aa  148  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  30.09 
 
 		 725 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 726 aa  146  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 736 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  25.49 
 
 		 770 aa  145  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.37 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 702 aa  145  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.06 
 
 		 763 aa  145  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 776 aa  144  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.91 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  28.01 
 
 		 657 aa  142  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 		 668 aa  142  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.37 
 
 		 699 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.12 
 
 		 876 aa  141  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 717 aa  141  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 396 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.82 
 
 		 753 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 690 aa  140  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 		 688 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 697 aa  137  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  31.51 
 
 		 674 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.92 
 
 		 670 aa  137  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 670 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 		 712 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 697 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.14 
 
 		 743 aa  135  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 833 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 648 aa  135  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 648 aa  135  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 817 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 685 aa  134  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.77 
 
 		 783 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 786 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.71 
 
 		 686 aa  133  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.14 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  34.5 
 
 		 702 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  29.74 
 
 		 685 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  31.33 
 
 		 641 aa  131  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  32.86 
 
 		 726 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  33.17 
 
 		 726 aa  131  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.78 
 
 		 722 aa  131  7.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 706 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 679 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  30.86 
 
 		 799 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  32.62 
 
 		 659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 701 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  28.17 
 
 		 700 aa  129  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>