More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3112 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  60.61 
 
 		 558 aa  700    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 556 aa  1114    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  60.47 
 
 		 557 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  63.29 
 
 		 554 aa  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  60.87 
 
 		 556 aa  678    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  62.01 
 
 		 557 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  71.07 
 
 		 556 aa  808    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  61.09 
 
 		 551 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  60.8 
 
 		 552 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  72.69 
 
 		 555 aa  827    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  64.67 
 
 		 552 aa  725    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  62.07 
 
 		 553 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  71.51 
 
 		 560 aa  787    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  56.81 
 
 		 552 aa  636    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 		 560 aa  640    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 		 554 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  64.62 
 
 		 553 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  60.04 
 
 		 554 aa  673    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  64.56 
 
 		 557 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 		 554 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  63.77 
 
 		 554 aa  690    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  60.65 
 
 		 552 aa  691    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  74.91 
 
 		 554 aa  830    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  71.79 
 
 		 555 aa  804    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  62.21 
 
 		 559 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  57.14 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  56.73 
 
 		 555 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  57.45 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  56.37 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  55.22 
 
 		 559 aa  608  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  54.98 
 
 		 563 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  56.19 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  56.16 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  56.26 
 
 		 554 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  55.56 
 
 		 565 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  55.68 
 
 		 553 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  55.42 
 
 		 553 aa  598  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  55.38 
 
 		 565 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  53.76 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  53.69 
 
 		 550 aa  595  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  53.42 
 
 		 558 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  54.58 
 
 		 559 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 		 550 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  53.42 
 
 		 558 aa  591  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  54.81 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  53.71 
 
 		 550 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  53.32 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  53.76 
 
 		 565 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  53.32 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 		 550 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 557 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  52.78 
 
 		 557 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  53.14 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  52.78 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  52.96 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  52.78 
 
 		 557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  52.78 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  52.6 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  52.96 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  56.99 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  53.16 
 
 		 550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  53.6 
 
 		 569 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  54.3 
 
 		 565 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  53.41 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  53.61 
 
 		 547 aa  566  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  52.98 
 
 		 550 aa  557  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 		 547 aa  552  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  52.88 
 
 		 579 aa  551  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 559 aa  549  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 561 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 560 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  50.72 
 
 		 580 aa  547  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  50.64 
 
 		 577 aa  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 553 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 553 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 561 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 553 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 561 aa  529  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 562 aa  528  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 613 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 558 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 562 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 562 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  48.26 
 
 		 576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 567 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2666  dihydroxy-acid dehydratase  46.05 
 
 		 611 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  47.47 
 
 		 576 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03310  Dihydroxy-acid dehydratase  46.77 
 
 		 612 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  47.29 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  45.5 
 
 		 614 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  47.21 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>