More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3097 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 426 aa  875    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2081  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.53 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.76 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0007  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.94 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2470  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  40 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000450435  decreased coverage  0.000021733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0003  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  35.73 
 
 		 457 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.05 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.02 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  32.84 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.15 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  26.81 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.81 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  26.34 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  27.04 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  27.04 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  27.04 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  27.04 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  27.04 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.98 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  31.2 
 
 		 482 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  32.38 
 
 		 456 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  26.67 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  27.12 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.04 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.75 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.84 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  26.11 
 
 		 446 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.61 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.4 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.79 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  26.67 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  26.05 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  25.69 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  30.77 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  25.63 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.96 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.44 
 
 		 566 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.29 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  27.76 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  27.76 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.72 
 
 		 457 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  26.8 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  27.07 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.78 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  27.21 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.42 
 
 		 570 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.38 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  32.04 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  30.75 
 
 		 500 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.52 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.51 
 
 		 721 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  28.4 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  28.4 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  31.93 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  22.89 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  28.28 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.7 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.75 
 
 		 503 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.46 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  27.46 
 
 		 452 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  27.46 
 
 		 452 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 445 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  30.65 
 
 		 615 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.19 
 
 		 489 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  30.07 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  22.92 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  28.05 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  22.67 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.82 
 
 		 652 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  30.06 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  28.44 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  24.62 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  25.68 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.24 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  27.64 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  28.93 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  27.65 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  30.27 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.75 
 
 		 527 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  24.51 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  29.88 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.36 
 
 		 528 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  26.27 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  28.69 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  31.22 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  28.18 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.77 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  27.58 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.55 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  28.28 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  29.31 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>