More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2996 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 173 aa  353  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  64.16 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  66.27 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  66.47 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  64.46 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  55.97 
 
 		 171 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  60.48 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.76 
 
 		 197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  47.93 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 202 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  53.46 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 230 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.12 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 232 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 194 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 		 219 aa  175  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.29 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  47.2 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  52.17 
 
 		 249 aa  175  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 229 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 225 aa  175  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 252 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  50.94 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 193 aa  171  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  51.27 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  53.8 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  50.99 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 195 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  52.91 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  52.56 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.17 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1713  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 357 aa  168  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 194 aa  168  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.9 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  49.35 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  49.69 
 
 		 170 aa  167  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 143 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  52.83 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>