More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2921 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 
338 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.39 
 
 
338 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  48.66 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
335 aa  330  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  53.59 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  46.71 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  53.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  52.99 
 
 
340 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.49 
 
 
334 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 
334 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
364 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.59 
 
 
333 aa  316  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.41 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
337 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  46.88 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  45.51 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.49 
 
 
334 aa  301  9e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.96 
 
 
345 aa  298  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.58 
 
 
333 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.57 
 
 
336 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
335 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
335 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  43.2 
 
 
341 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 
336 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  45.07 
 
 
336 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  45.07 
 
 
336 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  44.78 
 
 
336 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  43.28 
 
 
336 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
336 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
336 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  45.35 
 
 
337 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 
334 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
336 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.28 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  43.36 
 
 
339 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  44.65 
 
 
355 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  44.58 
 
 
336 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
346 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
337 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
334 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
365 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
352 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  41.84 
 
 
339 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
334 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
352 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
306 aa  287  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.14 
 
 
336 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
336 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
381 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  43.24 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  42.48 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  42.48 
 
 
339 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  43.67 
 
 
334 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  43.32 
 
 
336 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
336 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
347 aa  285  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.75 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.15 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.86 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  41.54 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  43.03 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  43.03 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  42.43 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  42.43 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
346 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  43.03 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  41.89 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
336 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
335 aa  281  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  42.43 
 
 
351 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
355 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  45.11 
 
 
356 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  42.9 
 
 
336 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
355 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
334 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>