More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2872 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
397 aa  804    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  58.87 
 
 
405 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  59.9 
 
 
402 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  59.44 
 
 
399 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  56.63 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  56.81 
 
 
401 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.26 
 
 
396 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  47.09 
 
 
395 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
395 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.59 
 
 
397 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  49.36 
 
 
396 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.45 
 
 
396 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  47.73 
 
 
396 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.58 
 
 
402 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.57 
 
 
395 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
397 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.18 
 
 
397 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
399 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
399 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  47.47 
 
 
399 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  45.08 
 
 
396 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.51 
 
 
387 aa  363  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  46.45 
 
 
400 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.34 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  46.62 
 
 
400 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  48.2 
 
 
401 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.01 
 
 
400 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
392 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  48.2 
 
 
418 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.33 
 
 
399 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.98 
 
 
418 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.23 
 
 
417 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.98 
 
 
418 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.29 
 
 
396 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  48.12 
 
 
402 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.76 
 
 
395 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
388 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
388 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.96 
 
 
397 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
396 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48 
 
 
398 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
423 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.18 
 
 
402 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.51 
 
 
394 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.01 
 
 
396 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
427 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.45 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.58 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  46.74 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  46.68 
 
 
399 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
427 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 
389 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
403 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.23 
 
 
396 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  45.72 
 
 
389 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
394 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
391 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  47.62 
 
 
390 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  45.1 
 
 
404 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  48.4 
 
 
394 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  47.29 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  44.77 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.45 
 
 
394 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  44.68 
 
 
398 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
392 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
394 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
403 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
403 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  44.79 
 
 
401 aa  322  9.000000000000001e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  44.94 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.65 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  46.15 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  44.71 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  45.92 
 
 
399 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
405 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
401 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
402 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 
386 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  42.86 
 
 
390 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 
398 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
386 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  44.77 
 
 
410 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
446 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
404 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  44.77 
 
 
398 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
386 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.25 
 
 
410 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  44.97 
 
 
405 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 
400 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>