More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2870 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  62.5 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  59.36 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  55.09 
 
 		 221 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  56.28 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  46.27 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  46.19 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  49.29 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  46.19 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  46.7 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  51.66 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  52.97 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  51.76 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  50.75 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  47.78 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  47.14 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  49.76 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  50 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  45.97 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  45.67 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  45.63 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  40.19 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  40.57 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  47.76 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  47.89 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  43.48 
 
 		 226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  44.28 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  49.49 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  49.49 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  51.21 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.11 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  42.18 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  41.78 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  45.02 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  42.99 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  38.79 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  34.73 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  34.18 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.6 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.95 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.32 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  39 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.85 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  35.6 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  37.31 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  34.47 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  36.87 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.52 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  33.99 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.44 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  34.43 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  35.52 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  35.38 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 268 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  33.5 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  33.49 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  35.29 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.22 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  32.56 
 
 		 297 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  34.03 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  32.8 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.12 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.36 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  32.23 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.8 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.72 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  31.72 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  41.18 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  29.35 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  26.87 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.07 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.93 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  29.1 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  32.18 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.96 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  33.14 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  30.56 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  29.33 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.26 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  30.73 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  32.28 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.12 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  29.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  30.61 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  30.61 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  31.12 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  28.11 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  30.61 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.6 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  30.1 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.8 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>