More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2716 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  83.12 
 
 		 154 aa  264  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.42 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  40 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  35.97 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.75 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.6 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  36.43 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  38.69 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.1 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  35.04 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.53 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.55 
 
 		 307 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.1 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  35.82 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  34.48 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.47 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.58 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  33.09 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.54 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.81 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.54 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.58 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  37.06 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  33.82 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.45 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.11 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.8 
 
 		 295 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.21 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.86 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.13 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  33.09 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.37 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.35 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  35.21 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  29.08 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  35.21 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.86 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  27.59 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.78 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.66 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.79 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.21 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  28.28 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  36.3 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.51 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  33.8 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.56 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  35.16 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  35.97 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  28.47 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.57 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.99 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.78 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.86 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  33.57 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34.97 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>