More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2586 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  43.95 
 
 		 252 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  40.99 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  42.14 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  37.43 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  37.43 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  36.26 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  36.9 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  36.09 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  36.2 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  33.74 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.96 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  36.76 
 
 		 264 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  33.14 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 227 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  32.72 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  29.69 
 
 		 207 aa  84.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 213 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.93 
 
 		 232 aa  84.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  41.18 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.9 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  41.18 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.81 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  36.84 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  40.32 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  36.84 
 
 		 396 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  36.84 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  36.84 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.25 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 281 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.19 
 
 		 264 aa  80.9  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 869 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  30.93 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  36.76 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 473 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.06 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  36.25 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2859  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  30.9 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.57 
 
 		 378 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  31.45 
 
 		 897 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  38.06 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.58 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  34.36 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  34.59 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  28.57 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 910 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  36.72 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 392 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 392 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.58 
 
 		 386 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  30.99 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  36.73 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  32 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  30.99 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>