More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2579 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
786 aa  1542    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.76 
 
 
729 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
729 aa  193  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
883 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
767 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
884 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
860 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.86 
 
 
882 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
800 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.6 
 
 
1676 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.13 
 
 
864 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.4 
 
 
882 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.97 
 
 
929 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  25.29 
 
 
811 aa  118  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
934 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
931 aa  107  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
927 aa  107  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  26.78 
 
 
603 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 
553 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  25.57 
 
 
824 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.28 
 
 
935 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.15 
 
 
884 aa  101  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
952 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
886 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
944 aa  99  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 
586 aa  96.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
886 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
955 aa  89.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
4079 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
878 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  26.49 
 
 
573 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
923 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
574 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
900 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.49 
 
 
557 aa  79  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
511 aa  79  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.27 
 
 
810 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
573 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 
567 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.8 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.54 
 
 
937 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.52 
 
 
267 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
591 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.67 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
1069 aa  74.7  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.15 
 
 
883 aa  74.7  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  24.22 
 
 
931 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.23 
 
 
575 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  37.57 
 
 
924 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
827 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.61 
 
 
638 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 
573 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  26.77 
 
 
642 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.29 
 
 
924 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  29.28 
 
 
591 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.24 
 
 
1979 aa  71.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
594 aa  71.2  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
568 aa  71.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
573 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
927 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 
265 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  39.17 
 
 
562 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  27.65 
 
 
475 aa  70.5  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
573 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.95 
 
 
645 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.72 
 
 
590 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.34 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
740 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  28.25 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.05 
 
 
1138 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
581 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 
643 aa  68.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.08 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  23.89 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  42.48 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.17 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 
572 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
847 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  42.48 
 
 
559 aa  67.8  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.22 
 
 
988 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  27.39 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
767 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  25.16 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.17 
 
 
561 aa  67.4  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
616 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.32 
 
 
837 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.78 
 
 
1737 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
613 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 
566 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 
2240 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>