63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2548 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 399 aa  819    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.85 
 
 		 697 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  34.95 
 
 		 867 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 749 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.08 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4481  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.21 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  25.93 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  25.88 
 
 		 343 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.41 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  26.32 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1031  iron-sulfur cluster-binding protein  44.83 
 
 		 63 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.125159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.46 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 65 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  23.91 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1358  ferredoxin  43.86 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  46.81 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 65 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  43.75 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1047  ferredoxin  37.88 
 
 		 170 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2519  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 85 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.9 
 
 		 57 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1233  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  40.43 
 
 		 315 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1786  ferredoxin  39.66 
 
 		 170 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0870  ferredoxin  39.66 
 
 		 170 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00207801 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 57 aa  46.6  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0932  ferredoxin  37.29 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  40.74 
 
 		 57 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.37 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 		 67 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1418  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  40.43 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  37.04 
 
 		 60 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  38.3 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.15 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2701  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 85 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 57 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  35.19 
 
 		 594 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.83 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 76 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0867  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  39.22 
 
 		 68 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000250696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.69 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1052  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.2 
 
 		 111 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0602855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1518  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 132 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0674  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  45.65 
 
 		 86 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.898929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.31 
 
 		 759 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44 
 
 		 211 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  36.73 
 
 		 70 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00580  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  34.48 
 
 		 62 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00222598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  34.69 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 55 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0644  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.89 
 
 		 68 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000788909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.48 
 
 		 635 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 70 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1416  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.14 
 
 		 180 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 57 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>