More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2455 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 		 452 aa  902    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  60.63 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  54.81 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  47.99 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  42.26 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  37.47 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  36.2 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  36.2 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  35.56 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  36.2 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  36.81 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  36.26 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  37.22 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  35.76 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  36.34 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 		 458 aa  282  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 		 458 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  36.12 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  36.78 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  36.78 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  36.12 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  34.44 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  36.87 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  37.47 
 
 		 458 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  35.4 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  37 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  37.36 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  35.4 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  35.46 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  35.9 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  35.02 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  35.62 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  35.62 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  34.8 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  34.8 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  34.8 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  34.8 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  34.8 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  35.13 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  34.05 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  35.1 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  35.84 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  34.06 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  35.4 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  34.81 
 
 		 458 aa  269  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  34.36 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  34.81 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  33.84 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  35.9 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 		 469 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  35.4 
 
 		 457 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  33.11 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  34.81 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  33.62 
 
 		 469 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  35.46 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  35.25 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  34.89 
 
 		 457 aa  262  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 		 469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  34.22 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  34 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  39.28 
 
 		 477 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 		 458 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  36.83 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  34.44 
 
 		 459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  32.67 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  33.11 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  33.63 
 
 		 445 aa  240  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.77 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  34.07 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>