More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2426 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 		 4800 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1884 aa  3398    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 2836 aa  533  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 		 3954 aa  505  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 2097 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.51 
 
 		 4334 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.35 
 
 		 1390 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.99 
 
 		 1145 aa  403  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  37.75 
 
 		 1400 aa  400  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 		 1855 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  38.34 
 
 		 1079 aa  353  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.95 
 
 		 1628 aa  335  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.23 
 
 		 2954 aa  330  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.5 
 
 		 2911 aa  327  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.02 
 
 		 1582 aa  317  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  39.05 
 
 		 833 aa  299  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.31 
 
 		 1544 aa  292  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.57 
 
 		 1363 aa  290  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  34.11 
 
 		 1072 aa  267  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.75 
 
 		 2678 aa  259  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  45.6 
 
 		 556 aa  252  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  32.54 
 
 		 1213 aa  249  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.51 
 
 		 946 aa  241  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.05 
 
 		 1279 aa  237  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 2467 aa  226  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 965 aa  224  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.36 
 
 		 1156 aa  221  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.71 
 
 		 1499 aa  220  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.59 
 
 		 1895 aa  220  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.79 
 
 		 3209 aa  199  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.48 
 
 		 2689 aa  197  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1424 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.85 
 
 		 3598 aa  183  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.61 
 
 		 1534 aa  182  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.02 
 
 		 3026 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  27.01 
 
 		 14829 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  33.61 
 
 		 860 aa  177  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.4 
 
 		 745 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 		 824 aa  174  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 		 1286 aa  173  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  37.64 
 
 		 1112 aa  172  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  34.7 
 
 		 1864 aa  172  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  37.41 
 
 		 1112 aa  169  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.9 
 
 		 2107 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.53 
 
 		 1415 aa  163  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.38 
 
 		 1795 aa  164  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.65 
 
 		 1532 aa  163  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  28.24 
 
 		 2133 aa  162  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.71 
 
 		 3619 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 589 aa  159  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.69 
 
 		 613 aa  159  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.16 
 
 		 4798 aa  158  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  28 
 
 		 15831 aa  156  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  37.78 
 
 		 595 aa  155  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.77 
 
 		 3427 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  32.22 
 
 		 764 aa  154  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.67 
 
 		 833 aa  152  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  44.15 
 
 		 759 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.85 
 
 		 1236 aa  148  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.1 
 
 		 1197 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.13 
 
 		 3608 aa  146  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  28.91 
 
 		 1217 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.87 
 
 		 1164 aa  146  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.58 
 
 		 2105 aa  146  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.74 
 
 		 2807 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  47.84 
 
 		 4687 aa  144  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.51 
 
 		 2245 aa  143  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.48 
 
 		 2775 aa  142  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.98 
 
 		 2950 aa  139  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.52 
 
 		 2667 aa  138  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.24 
 
 		 648 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.67 
 
 		 518 aa  135  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.37 
 
 		 526 aa  135  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.61 
 
 		 855 aa  135  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.13 
 
 		 795 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  53.59 
 
 		 982 aa  135  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.64 
 
 		 3619 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.73 
 
 		 980 aa  134  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  47.77 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  41.35 
 
 		 437 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  39.54 
 
 		 437 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 9867 aa  130  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  31.99 
 
 		 1134 aa  129  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  27.3 
 
 		 6581 aa  127  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.43 
 
 		 1480 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.92 
 
 		 4723 aa  126  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.19 
 
 		 1287 aa  126  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.92 
 
 		 1421 aa  126  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.39 
 
 		 1814 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 387 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 		 396 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  27.98 
 
 		 1168 aa  123  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.56 
 
 		 769 aa  123  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  33.05 
 
 		 623 aa  122  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 		 393 aa  122  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.17 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.08 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.08 
 
 		 2668 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 		 329 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 		 329 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>