More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2391 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  77.3 
 
 		 394 aa  650    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 397 aa  827    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  79.59 
 
 		 394 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  79.59 
 
 		 394 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  80.61 
 
 		 393 aa  668    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  82.14 
 
 		 393 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  71.43 
 
 		 395 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  70.05 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  67.34 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  66.33 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  63.41 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  63.48 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  55.67 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  53.83 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  52.42 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  52.54 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  50.26 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  54.21 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  51.15 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  47.19 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  44.36 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 407 aa  332  8e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  43.5 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.91 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 404 aa  292  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  42.86 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  38.5 
 
 		 410 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  39.17 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  38.83 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  38.61 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  38.06 
 
 		 406 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  38.89 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  36.34 
 
 		 375 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  36.39 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  38.27 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 		 496 aa  206  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  34.56 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  33.62 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 357 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  34.28 
 
 		 356 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 358 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 354 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.68 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.25 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  32.48 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  32.02 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  33.14 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.41 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 330 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.37 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  31.23 
 
 		 769 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  30.73 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.2 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>