92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2318 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  100 
 
 
121 aa  250  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  74.47 
 
 
330 aa  155  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  55.45 
 
 
198 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  43.44 
 
 
127 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.96 
 
 
334 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  47 
 
 
281 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  50.51 
 
 
339 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  47.42 
 
 
324 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  47.42 
 
 
324 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  47.37 
 
 
197 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  46.23 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  42 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  41 
 
 
336 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  49.47 
 
 
330 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  45.26 
 
 
328 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  43 
 
 
291 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  45 
 
 
342 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  42.86 
 
 
353 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  47.42 
 
 
329 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  44.66 
 
 
337 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  45.36 
 
 
319 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.31 
 
 
335 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  41.24 
 
 
341 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  39 
 
 
342 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  39.18 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  39 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  37.86 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  37.62 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  42.11 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  38.83 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  38 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  41.24 
 
 
333 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.53 
 
 
332 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  34.51 
 
 
335 aa  77  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  33.33 
 
 
354 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  37.27 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38.24 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  32.52 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  39 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  33 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  36.36 
 
 
336 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  37.08 
 
 
345 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  35.05 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  34 
 
 
350 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  36 
 
 
344 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  70.9  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  35.71 
 
 
334 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  45.95 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  38.2 
 
 
356 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  50.85 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  30.97 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  30.69 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  36.96 
 
 
344 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  34.31 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  35.48 
 
 
326 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  34.34 
 
 
352 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  35.48 
 
 
328 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  40.96 
 
 
340 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  32.29 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  36.73 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  36.46 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  33 
 
 
336 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  31 
 
 
333 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  32.58 
 
 
340 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  35.05 
 
 
242 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  33.7 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  29.46 
 
 
345 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  29.46 
 
 
345 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  50 
 
 
55 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  37 
 
 
342 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  29.59 
 
 
352 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  32.98 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  39.39 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  30.85 
 
 
256 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  39.56 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  31.52 
 
 
355 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  31.52 
 
 
355 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  31.96 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  32 
 
 
365 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  29.9 
 
 
350 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  37.21 
 
 
342 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  32.86 
 
 
90 aa  52  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  39.22 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  23.91 
 
 
351 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  23.91 
 
 
352 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  23.91 
 
 
352 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  26.09 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  24.42 
 
 
361 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  25.56 
 
 
357 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  25.84 
 
 
353 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  23.4 
 
 
344 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>