More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2304 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
473 aa  982  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 
478 aa  637  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.8 
 
 
473 aa  785  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.17 
 
 
479 aa  728  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.48 
 
 
473 aa  759  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.87 
 
 
479 aa  756  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 
472 aa  640  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 
478 aa  635  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.85 
 
 
479 aa  767  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.53 
 
 
472 aa  650  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 
471 aa  650  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.17 
 
 
471 aa  650  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 
478 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 
471 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.27 
 
 
480 aa  623  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 
471 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  62.47 
 
 
476 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.85 
 
 
480 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.02 
 
 
471 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  62.47 
 
 
475 aa  613  1e-174  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.95 
 
 
493 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.62 
 
 
481 aa  608  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  62.61 
 
 
483 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  62.47 
 
 
475 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.47 
 
 
485 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.82 
 
 
476 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.22 
 
 
471 aa  605  1e-172  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
496 aa  605  1e-172  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.03 
 
 
491 aa  607  1e-172  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  62.39 
 
 
485 aa  607  1e-172  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.03 
 
 
491 aa  607  1e-172  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
490 aa  603  1e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  62.39 
 
 
478 aa  603  1e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
480 aa  603  1e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.23 
 
 
485 aa  603  1e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.47 
 
 
491 aa  602  1e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
496 aa  603  1e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.05 
 
 
472 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.88 
 
 
472 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
476 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
492 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.66 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.84 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.84 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.97 
 
 
491 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.82 
 
 
472 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.84 
 
 
472 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.01 
 
 
474 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.47 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.45 
 
 
473 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  61.33 
 
 
495 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.39 
 
 
492 aa  594  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.38657e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.26 
 
 
475 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09982e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.83 
 
 
464 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.72 
 
 
512 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
498 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 
476 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.82 
 
 
519 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.88 
 
 
476 aa  583  1e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.45 
 
 
473 aa  582  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.51 
 
 
441 aa  578  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.83 
 
 
473 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.72 
 
 
441 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.69 
 
 
464 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.16 
 
 
476 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.91 
 
 
476 aa  575  1e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.58 
 
 
474 aa  576  1e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  61.41 
 
 
481 aa  577  1e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.03 
 
 
479 aa  577  1e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.96 
 
 
474 aa  573  1e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.84 
 
 
474 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.34 
 
 
477 aa  571  1e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.62 
 
 
472 aa  572  1e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.59 
 
 
437 aa  572  1e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.3 
 
 
485 aa  573  1e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
476 aa  573  1e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  7.92408e-15  hitchhiker  2.66691e-05 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.34 
 
 
477 aa  571  1e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  59.02 
 
 
498 aa  574  1e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.21 
 
 
472 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.5 
 
 
495 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.69 
 
 
465 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.05 
 
 
471 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.63 
 
 
514 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.21 
 
 
470 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.21 
 
 
494 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.47 
 
 
465 aa  568  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.62 
 
 
475 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
472 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.12 
 
 
472 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
477 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.04 
 
 
470 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
477 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>