228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2291 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  326  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  64.81 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  63.58 
 
 		 163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  59.88 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  48.47 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  160  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  47.24 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  45.06 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  44.44 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  45.73 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  41.61 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  47.53 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  42.59 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  44.79 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>