76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2260 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  39.68 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  41.46 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.63 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  43.23 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  35.66 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.61 
 
 		 260 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  37.84 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  28.29 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  23.4 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  24.24 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.73 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.04 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  28.45 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  26.35 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  28.57 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  25.25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.81 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  29 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  26.32 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  25.71 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.03 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  28.93 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  29.81 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  32.5 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  28.83 
 
 		 401 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  25 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  26.04 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  21.13 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  21.13 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  21.13 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.35 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  21.13 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  21.13 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  28.41 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.72 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  25.62 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  26.92 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  20 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.62 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  27.62 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  21.05 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.59 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  27.78 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  25.64 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  23.23 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.12 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  26.2 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  28.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.64 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  23.85 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.9 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  23.96 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  30.43 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.05 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  26.19 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.97 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.74 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  20.39 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1040  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  26.61 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  23.96 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  24.32 
 
 		 191 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 166 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  19.72 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.74 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.74 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 		 445 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  24.16 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  32.76 
 
 		 167 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>